อนุมูลอิสระสามารถแบ่งได้เป็น 2 ชนิดง่ายๆ คือ
1. อนุมูลอิสระที่เกิดขึ้นในร่างกาย ซึ่งเป็นผลมาจากกระบวนการเผาผลาญสารอาหารของร่างกาย เพื่อให้เกิดเป็นพลังงาน แต่ในกระบวนการเผาผลาญนี้ เกิดปฏิกิริยาออกซิเดชัน ทำให้เกิดอนุมูลอิสระขึ้นมานั่นเอง
2. อนุมูลอิสระจากภายนอกร่างกาย เช่น การติดเชื้อ ทั้งจากแบคทีเรียและไวรัส รังสียูวี รังสีเอกซ์เรย์และรังสีอื่นๆ สิ่งแวด